Protein–RNA interactions for Protein: Q494U1

PLEKHN1, Pleckstrin homology domain-containing family N member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHN1Q494U1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PLEKHN1Q494U1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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