Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms