Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
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