Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MSMPQ1L6U9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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