Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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RPE65Q16518 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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RPE65Q16518 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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RPE65Q16518 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
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RPE65Q16518 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RPE65Q16518 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RPE65Q16518 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RPE65Q16518 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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