Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms