Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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