Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
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NFIXQ14938 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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