Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNB1Q14721 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms