Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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