Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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