Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBFBQ13951 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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