Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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