Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.5 ms