Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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PTGDRQ13258 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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PTGDRQ13258 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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PTGDRQ13258 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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