Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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CALCOCO2Q13137 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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CALCOCO2Q13137 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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CALCOCO2Q13137 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CALCOCO2Q13137 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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