Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PRKAA1Q13131 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PRKAA1Q13131 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PRKAA1Q13131 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PRKAA1Q13131 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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PRKAA1Q13131 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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PRKAA1Q13131 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKAA1Q13131 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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PRKAA1Q13131 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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PRKAA1Q13131 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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PRKAA1Q13131 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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PRKAA1Q13131 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRKAA1Q13131 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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