Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF1Q13077 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms