Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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STRN3Q13033 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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