Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
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