Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms