Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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