Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CDH17Q12864 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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