Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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