Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms