Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms