Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK18Q07002 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms