Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DEUP1Q05D60 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms