Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTDSPL2Q05D32 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms