Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC092474.1-201ENST00000416158 1167 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 LINC02148-201ENST00000503877 1223 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 CASC20-201ENST00000415932 1484 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNB1Q02641 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 FRG1-201ENST00000226798 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 GNAS-209ENST00000371081 730 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL365203.1-201ENST00000450890 1048 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 LINC02116-201ENST00000509455 493 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL133372.2-202ENST00000549360 768 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 LINC02152-201ENST00000566208 1281 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 UBXN8-207ENST00000615729 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL590240.2-201ENST00000413370 894 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 AC013402.3-201ENST00000438566 451 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB1Q02641 RPL12P33-201ENST00000485633 492 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms