Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNC1Q01954 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms