Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms