Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms