Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS3AP61247 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPS3AP61247 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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