Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP107P57740 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUP107P57740 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms