Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HADHBP55084 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HADHBP55084 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HADHBP55084 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HADHBP55084 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HADHBP55084 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HADHBP55084 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HADHBP55084 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HADHBP55084 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HADHBP55084 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HADHBP55084 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HADHBP55084 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HADHBP55084 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HADHBP55084 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HADHBP55084 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HADHBP55084 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HADHBP55084 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms