Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPAP53621 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPAP53621 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPAP53621 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPAP53621 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPAP53621 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPAP53621 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPAP53621 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
COPAP53621 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPAP53621 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPAP53621 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPAP53621 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPAP53621 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPAP53621 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPAP53621 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPAP53621 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPAP53621 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPAP53621 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPAP53621 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPAP53621 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPAP53621 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPAP53621 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPAP53621 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.6 ms