Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPIAP49247 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPIAP49247 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPIAP49247 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPIAP49247 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPIAP49247 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPIAP49247 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPIAP49247 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPIAP49247 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPIAP49247 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPIAP49247 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPIAP49247 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms