Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP2P42575 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP2P42575 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP2P42575 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms