Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms