Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms