Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXA13P31271 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms