Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

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Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A5P29400 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms