Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD38P28907 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD38P28907 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD38P28907 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD38P28907 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD38P28907 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD38P28907 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD38P28907 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD38P28907 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD38P28907 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD38P28907 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD38P28907 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD38P28907 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD38P28907 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD38P28907 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD38P28907 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD38P28907 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD38P28907 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD38P28907 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD38P28907 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD38P28907 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD38P28907 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD38P28907 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD38P28907 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD38P28907 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD38P28907 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD38P28907 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD38P28907 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD38P28907 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD38P28907 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD38P28907 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD38P28907 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms