Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRMP28827 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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