Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD27P26842 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD27P26842 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD27P26842 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD27P26842 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD27P26842 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CD27P26842 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD27P26842 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD27P26842 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD27P26842 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD27P26842 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD27P26842 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD27P26842 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms