Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR2AP24928 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR2AP24928 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms