Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PTPRBP23467 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PTPRBP23467 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PTPRBP23467 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PTPRBP23467 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PTPRBP23467 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PTPRBP23467 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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