Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HRCP23327 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HRCP23327 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HRCP23327 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HRCP23327 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HRCP23327 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HRCP23327 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HRCP23327 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HRCP23327 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HRCP23327 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HRCP23327 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HRCP23327 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HRCP23327 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HRCP23327 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HRCP23327 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HRCP23327 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HRCP23327 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HRCP23327 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HRCP23327 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HRCP23327 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HRCP23327 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HRCP23327 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HRCP23327 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HRCP23327 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HRCP23327 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HRCP23327 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HRCP23327 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HRCP23327 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HRCP23327 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HRCP23327 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HRCP23327 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HRCP23327 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HRCP23327 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HRCP23327 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HRCP23327 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HRCP23327 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HRCP23327 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HRCP23327 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HRCP23327 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HRCP23327 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HRCP23327 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HRCP23327 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HRCP23327 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HRCP23327 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HRCP23327 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms