Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD247P20963 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD247P20963 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms